Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC4Q13426 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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