Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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PTPRSQ13332 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRSQ13332 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23■■□□□ 1.27
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PTPRSQ13332 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRSQ13332 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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