Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPPAQ13219 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAPPAQ13219 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPPAQ13219 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms