Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HSPB3Q12988 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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