Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FOXD4Q12950 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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FOXD4Q12950 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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