Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNH2Q12809 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNH2Q12809 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNH2Q12809 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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