Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 ALE1YOR175C 1860 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YDR115WYDR115W 318 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 UTR5YEL035C 501 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 PDA1YER178W 1263 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 MRS1YIR021W 1092 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 RPL19BYBL027W 570 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 DSC3YOR223W 879 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YCL022CYCL022C 516 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 POF1YCL047C 777 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 SER33YIL074C 1410 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YBP2YGL060W 1926 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 TDA7YNL176C 1911 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YJR003CYJR003C 1560 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 RIX7YLL034C 2514 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YJR015WYJR015W 1533 nt5.79□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YME1YPR024W 2244 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 TSL1YML100W 3297 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 HIS1YER055C 894 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 RPS24BYIL069C 408 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 YLR269CYLR269C 351 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 MED11YMR112C 396 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 VPS69YPR087W 321 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 SEC2YNL272C 2280 nt5.78□□□□□ -1.48
TY1A-BRQ12217 FUS2YMR232W 2034 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 NDT80YHR124W 1884 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MUB1YMR100W 1863 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 HXT15YDL245C 1704 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MSM1YGR171C 1728 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 HXT16YJR158W 1704 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YDL094CYDL094C 510 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 SKP1YDR328C 585 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YOR200WYOR200W 399 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YPR096CYPR096C 303 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PSP2YML017W 1782 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 ALG11YNL048W 1647 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RIM21YNL294C 1602 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RIM4YHL024W 2142 nt5.77□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 FAT3YKL187C 2253 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YPS7YDR349C 1791 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MPP10YJR002W 1782 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 NTF2YER009W 378 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MTM1YGR257C 1101 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PHS1YJL097W 654 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PIR1YKL164C 1026 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YKR041WYKR041W 753 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 VPS63YLR261C 327 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 SPG4YMR107W 348 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 TIM18YOR297C 579 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MRPL51YPR100W 423 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PDB1YBR221C 1101 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YEH2YLR020C 1617 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 SNF12YNR023W 1701 nt5.76□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 TKL1YPR074C 2043 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 ALT2YDR111C 1524 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 VNX1YNL321W 2727 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RTR2YDR066C 591 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 SDH6YDR379C-A 240 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 SHE2YKL130C 741 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 CCW12YLR110C 402 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PAU19YMR325W 375 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 BIL1YOR304C-A 231 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RPL43AYPR043W 279 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 NCS2YNL119W 1482 nt5.75□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 ICP55YER078C 1536 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 ARP2YDL029W 1176 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YDR090CYDR090C 933 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 ATP5YDR298C 639 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YGR053CYGR053C 852 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RGI2YIL057C 495 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 GCN3YKR026C 918 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RPP0YLR340W 939 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 CUE4YML101C 354 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RIM9YMR063W 720 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YAR1YPL239W 603 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PEX29YDR479C 1665 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 HXT5YHR096C 1779 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PMA1YGL008C 2757 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YOR365CYOR365C 2112 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 ILV1YER086W 1731 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RPN6YDL097C 1305 nt5.74□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YHR045WYHR045W 1683 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 CDC48YDL126C 2508 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 KEL1YHR158C 3495 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 TEF1YPR080W 1377 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 TEF2YBR118W 1377 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YDL068WYDL068W 330 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 HAC1YFL031W 717 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YGL193CYGL193C 312 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 FCF2YLR051C 654 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 YAR075WYAR075W 474 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 PGA3YML125C 939 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MKK2YPL140C 1521 nt5.73□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 FMP25YLR077W 1752 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 MIH1YMR036C 1665 nt5.72□□□□□ -1.49
TY1A-BRQ12217 RVB1YDR190C 1392 nt5.72□□□□□ -1.49
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