Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC173Q0VFZ6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC173Q0VFZ6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms