Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL18Q07020 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL18Q07020 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms