Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNDQ07001 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNDQ07001 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms