Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 POF1YCL047C 777 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YIR007WYIR007W 2295 nt5.48□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 IMD2YHR216W 1572 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 TRE1YPL176C 2352 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 AEP3YPL005W 1821 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 HNT1YDL125C 477 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 snR8snR8 190 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PEX4YGR133W 552 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YGR190CYGR190C 366 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 PAN6YIL145C 930 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ABM1YJR108W 372 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RPL18BYNL301C 561 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 RPS10AYOR293W 318 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 YPL225WYPL225W 441 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 VPS70YJR126C 2436 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ASI3YNL008C 2031 nt5.47□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 ADY4YLR227C 1482 nt5.46□□□□□ -1.53
HDA3Q06623 TRK2YKR050W 2670 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 MSS4YDR208W 2340 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SLY41YOR307C 1362 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 RIM101YHL027W 1878 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 GLO2YDR272W 825 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 HOR7YMR251W-A 180 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YNL150WYNL150W 408 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 APP1YNL094W 1764 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ROG3YFR022W 2202 nt5.46□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 RRN3YKL125W 1884 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 TEF1YPR080W 1377 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 TEF2YBR118W 1377 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 MNN2YBR015C 1794 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 TDA2YER071C 381 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SAE2YGL175C 1038 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YAR075WYAR075W 474 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 CGI121YML036W 546 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 RPL13BYMR142C 600 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YBL044WYBL044W 369 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ESF1YDR365C 1887 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 PIF1YML061C 2580 nt5.45□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SYP1YCR030C 2613 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 EXO5YBR163W 1758 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YBP2YGL060W 1926 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 HPF1YOL155C 2904 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 PRM7YDL039C 2097 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YDR149CYDR149C 708 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YGR017WYGR017W 894 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 REE1YJL217W 597 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YKL118WYKL118W 312 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 RFA1YAR007C 1866 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YML108WYML108W 318 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 PGA3YML125C 939 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 HPA2YPR193C 471 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 MCM4YPR019W 2802 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YRB30YGL164C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 MAG2YLR427W 2013 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SHE10YGL228W 1734 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 MSL5YLR116W 1431 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 VAM7YGL212W 951 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SOL4YGR248W 768 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SPC1YJR010C-A 285 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YKL044WYKL044W 321 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YKL070WYKL070W 510 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 AFB1YLR040C 675 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YMR087WYMR087W 855 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 MSE1YOL033W 1611 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 AAP1YHR047C 2571 nt5.43□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 SUL2YLR092W 2682 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 AEP1YMR064W 1557 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 CST6YIL036W 1764 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ALG6YOR002W 1635 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YDR053WYDR053W 396 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 CSE4YKL049C 690 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 DAD2YKR083C 402 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YLL044WYLL044W 447 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 BSC3YLR465C 309 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 AIM4YBR194W 372 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 PAM1YDR251W 2493 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ABZ1YNR033W 2364 nt5.42□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ECM3YOR092W 1842 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ERG7YHR072W 2196 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ADY2YCR010C 852 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 HOM2YDR158W 1098 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YER034WYER034W 558 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YIL024CYIL024C 570 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YKL151CYKL151C 1014 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YML009C-AYML009C-A 327 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 PAI3YMR174C 207 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 RPS11BYBR048W 471 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 HAA1YPR008W 2085 nt5.41□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 PRP11YDL043C 801 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 DPH1YIL103W 1278 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YIR020CYIR020C 303 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ARV1YLR242C 966 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 ARG80YMR042W 534 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 YPL035CYPL035C 348 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 CAM1YPL048W 1248 nt5.4□□□□□ -1.54
HDA3Q06623 KIN3YAR018C 1308 nt5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms