Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TNP2Q05952 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms