Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHRNB3Q05901 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms