Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GRIN1Q05586 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIN1Q05586 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms