Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKCZQ05513 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKCZQ05513 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms