Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC25A11Q02978 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC25A11Q02978 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC25A11Q02978 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms