Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TOP2BQ02880 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TOP2BQ02880 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TOP2BQ02880 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms