Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNFRSF17Q02223 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF17Q02223 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF17Q02223 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms