Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A3Q01959 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A3Q01959 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms