Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MS4A2Q01362 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MS4A2Q01362 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms