Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SCN7AQ01118 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCN7AQ01118 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms