Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDK5Q00535 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK5Q00535 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms