Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK3Q00526 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK3Q00526 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms