Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RELNP78509 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RELNP78509 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RELNP78509 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RELNP78509 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RELNP78509 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RELNP78509 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms