Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CSNK2A1P68400 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms