Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LMO4P61968 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LMO4P61968 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LMO4P61968 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMO4P61968 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMO4P61968 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMO4P61968 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms