Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVFC1P60507 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVFC1P60507 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms