Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLF3P57682 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLF3P57682 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF3P57682 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF3P57682 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF3P57682 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms