Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX10P56693 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX10P56693 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX10P56693 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX10P56693 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX10P56693 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms