Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH8P55286 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH8P55286 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH8P55286 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH8P55286 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH8P55286 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms