Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCPP55072 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCPP55072 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VCPP55072 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VCPP55072 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VCPP55072 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms