Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC12A2P55011 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC12A2P55011 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC12A2P55011 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC12A2P55011 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC12A2P55011 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC12A2P55011 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms