Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC5A3P53794 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC5A3P53794 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms