Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA8P53708 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms