Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LIMK2P53671 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIMK2P53671 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms