Protein–RNA interactions for Protein: P53081

NIF3, NGG1-interacting factor 3, yeastyeast

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIF3P53081 EPL1YFL024C 2499 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 TRM12YML005W 1389 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 MSS4YDR208W 2340 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 RMT2YDR465C 1239 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 GRX2YDR513W 432 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 SCM4YGR049W 564 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 RPS0AYGR214W 759 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 PHD1YKL043W 1101 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 YKR011CYKR011C 1062 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 SSN8YNL025C 972 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 VPS3YDR495C 3036 nt2.78□□□□□ -1.96
NIF3P53081 ATG26YLR189C 3597 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 TOM70YNL121C 1854 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 CIN8YEL061C 3003 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MAL12YGR292W 1755 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MAL32YBR299W 1755 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 ARO1YDR127W 4767 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MRH4YGL064C 1686 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YDL186WYDL186W 834 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 DOG2YHR043C 741 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 EBP2YKL172W 1284 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RPC37YKR025W 849 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 OMA1YKR087C 1038 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 HHF2YNL030W 312 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MUM2YBR057C 1101 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 PHO88YBR106W 567 nt2.77□□□□□ -1.97
NIF3P53081 PIN4YBL051C 2007 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 ROM1YGR070W 3468 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 BUD4YJR092W 4344 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YHR080CYHR080C 4038 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 PLM2YDR501W 1566 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YFL051CYFL051C 483 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RSM26YJR101W 801 nt2.76□□□□□ -1.97
NIF3P53081 CHO2YGR157W 2610 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 DSS1YMR287C 2910 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 KEG1YFR042W 603 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 TYS1YGR185C 1185 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 SWD2YKL018W 990 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MBR1YKL093W 1020 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 USB1YLR132C 873 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 UNG1YML021C 1080 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 snR11snR11 258 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 SUR1YPL057C 1149 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YPR142CYPR142C 564 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 SNQ2YDR011W 4506 nt2.75□□□□□ -1.97
NIF3P53081 ITT1YML068W 1395 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 VIP1YLR410W 3441 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 SPP382YLR424W 2127 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 CWC2YDL209C 1020 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YDR442WYDR442W 393 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YMR178WYMR178W 825 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YNL184CYNL184C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 HNT3YOR258W 654 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YPR078CYPR078C 1119 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RRM3YHR031C 2172 nt2.74□□□□□ -1.97
NIF3P53081 EXO84YBR102C 2262 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 STT4YLR305C 5703 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RDI1YDL135C 609 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 IZH1YDR492W 951 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 ISC10YER180C 804 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MTD1YKR080W 963 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 ENV10YLR065C 546 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RPN13YLR421C 471 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RPS10BYMR230W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 AAH1YNL141W 1044 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YNL234WYNL234W 1281 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 IRC14YOR135C 342 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 TSC11YER093C 4293 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 MTL1YGR023W 1656 nt2.73□□□□□ -1.97
NIF3P53081 UBP5YER144C 2418 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 CMK1YFR014C 1341 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 EXO5YBR163W 1758 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 NOP4YPL043W 2058 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 OTU1YFL044C 906 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 GLG2YJL137C 1143 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YLR311CYLR311C 348 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 SEC14YMR079W 915 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 DSC2YOL073C 969 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 VAS1YGR094W 3315 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 SOK1YDR006C 2706 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 FLO1YAR050W 4614 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 RIX1YHR197W 2292 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 CEX1YOR112W 2286 nt2.72□□□□□ -1.97
NIF3P53081 HFM1YGL251C 3564 nt2.71□□□□□ -1.97
NIF3P53081 PDC2YDR081C 2778 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 PAN5YHR063C 1140 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 LAC1YKL008C 1257 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 SIC1YLR079W 855 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 HMX1YLR205C 954 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 SEC65YML105C 822 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 YNL109WYNL109W 546 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 RPL20BYOR312C 519 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 HUT1YPL244C 1020 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 PIN3YPR154W 648 nt2.71□□□□□ -1.98
NIF3P53081 RPL19AYBR084C-A 570 nt2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms