Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BRCA2P51587 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRCA2P51587 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms