Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDE6CP51160 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDE6CP51160 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDE6CP51160 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms