Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLK2P49760 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLK2P49760 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLK2P49760 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLK2P49760 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLK2P49760 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLK2P49760 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLK2P49760 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLK2P49760 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms