Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARCN1P48444 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms