Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GNPDA1P46926 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms