Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC1A4P43007 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC1A4P43007 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC1A4P43007 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms