Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIK3CAP42336 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms