Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP8P40818 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP8P40818 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP8P40818 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP8P40818 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP8P40818 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP8P40818 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP8P40818 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP8P40818 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP8P40818 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP8P40818 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP8P40818 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP8P40818 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP8P40818 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP8P40818 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP8P40818 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP8P40818 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP8P40818 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP8P40818 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP8P40818 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms