Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4AP40617 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARL4AP40617 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARL4AP40617 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms