Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NUP62P37198 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NUP62P37198 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NUP62P37198 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms