Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM23P36406 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM23P36406 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms