Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCR1P32246 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCR1P32246 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCR1P32246 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCR1P32246 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCR1P32246 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms