Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSPOP30536 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TSPOP30536 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TSPOP30536 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPOP30536 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TSPOP30536 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TSPOP30536 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms