Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM4SF1P30408 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM4SF1P30408 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms